分子蒸餾儀也稱短程蒸餾儀，是一種在高真空下(殘氣分子的壓力<0.1Pa)進行的連續蒸餾過程的儀器。分子蒸餾過程與傳統的蒸餾過程不同，傳統蒸餾是在沸點溫度下進行分離的，蒸發與冷凝過程是可逆的，液相與汽相間會形成平衡狀態。分子蒸餾過程是一個不可逆的，并且在遠離物質常壓沸點溫度下進行的蒸餾過程，更確切地說，它是分子蒸發的過程。（1）分子運動平均自由程。任一分子在運動過程中都在不斷變化自由程，在某時間間短程分子蒸餾儀隔內自由程的平均值為平均自由程。設Vm為某一分子的平均速度，f為碰撞頻率，λm為平均自由程。則λm=Vm/f，故f=Vm/λm 。（2）分離因數 Langmuir研究了高真空下純物質的蒸發現象，從理論上推導出純物質的分子蒸發速率與普通蒸餾相比，分子蒸餾理論分離因數增加了(MB/MA)1/2倍，因此，分子蒸餾技術可以用來分離揮發度相近但分子量不同的混合物系。（3）分子蒸餾技術的基本原理。根據分子運動平均自由程公式知，不同種類的分子，由于其分子有效直徑不同，故其平均自由程也不同，即其為不同種類分子。
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