(一)使用 超凈工作臺使用前應用紫外燈照射30-40分鐘，并檢查操作區周圍各種可開啟的門窗處于工作時位置。操作好在操作區的中心位置進行，在設計上，這是一個較安全的區域。在進行操作前應對實驗材料有一個初步的認識，同時了解自已所使用的設備的性能及安全等級。嚴格執行實驗室安全規程。特定病原在任何超凈工作臺中的使用必須進行安全性評估。如果實驗材料會對周圍環境造成環境污染，就應避免在無排氣濾板的型號內使用，因為在流動空氣中操作與散毒無異。任何*設備并不能保證實驗的成功，動物檢疫實驗室超凈工作臺的使用是以無菌和避免交叉污染為目的，因此熟練的操作和明確的無菌要領是不可少的。
(二)維護 超凈工作臺是一臺較精密的電氣設備，對其進行經常性的保養和維護是非常重要的。首先要保持室內的干燥和清潔，潮濕的空氣既會使制造材料銹蝕，還會影響電氣電路的正常工作，潮濕空氣還利于細菌、霉菌的生長。清潔的環境還可延長濾板的使用壽命。另外，定期對設備的清潔是正常使用的重要環節。清潔應包括使用前后的例行清潔和定期的處理。熏蒸時，應將所有縫隙*密封，如操作口設有可移動擋板封蓋的類型超凈工作臺，可用塑料薄膜密封。超凈工作臺的濾板和紫外殺菌燈都有標定的使用年限，應按期更換。
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